無塵室與普通通風空調的區別在于，潔凈室是空調工程中的一種，它不僅對室內空氣的溫度、濕度、風速有一定的要求，而且對空氣中的塵粒數、細菌濃度都有很高的要求。所以通風工程的設計和施工不僅對建筑布局、材料選擇、施工工序、建筑做法、水暖電通和工藝本身的設計、施工都有特殊要求，并相應提高其成本。

       2、空氣過濾手段一般空調有的只有粗效一級過濾，要求較高的是粗效中效二級過濾處理。但空調凈化需要的是三級過濾，即粗、中、中三級過濾或粗、中、亞高效三級過濾。生潔室除供風系統具有三級過濾功能外，還可根據不同情況設置二級高效過濾或濾毒吸附過濾，以消除動物特有的臭味和避免對環境的污染。

       3、室內壓力要求一般空調對室內壓力沒有特殊要求，而潔凈空調為避免外界污染空氣的滲入，或者不同生產車間不同物質的相互影響，對不同潔凈區的正壓值有不同的要求。負壓潔凈室內仍有負壓控制要求。